基本信息
方巧君  女  博导  国家纳米科学中心
电子邮件: fangqj@nanoctr.cn
通信地址: 中关村北一条11号南楼302
邮政编码: 100190

研究领域

   

招生信息

   
招生专业
071010-生物化学与分子生物学
071021-生物信息学
071023-计算生物学
招生方向
纳米医学,纳米系统生物学
系统生物学
蛋白组学,基因组学

教育背景

2000-06--2005-10   约翰霍普金斯大学医学院   博士
1996-09--1999-06   北京大学   硕士
1991-09--1996-06   北京大学   学士
学历
   
学位
   

工作经历

   
工作简历
2013-02~现在, 国家纳米科学中心, 研究员
2009-07~2013-01,Fred Hutchinson Cancer Research Center, 正式科研人员
2007-02~2009-06,Fred Hutchinson Cancer Research Center, 博士后
2005-10~2007-01,约翰霍普金斯大学医学院, 博士后
2000-06~2005-10,约翰霍普金斯大学医学院, 博士
1996-09~1999-06,北京大学, 硕士
1991-09~1996-06,北京大学, 学士
社会兼职
2017-11-01-2021-10-31,中国生物物理学纳米生物学分会理事, 理事

教授课程

纳米生物理论模拟
纳米生物学概论
Nanobiotechnology

专利与奖励

   
奖励信息
   
专利成果
( 1 ) 一种特异靶向HER2蛋白的多肽, 2017, 第 2 作者, 专利号: 201410359780.9
( 2 ) 一种特异靶向HER2蛋白的多肽及其应用, 2015, 第 2 作者, 专利号: 201510583724.8
( 3 ) 一种特异靶向EGFR 蛋白的多肽及其应用, 2015, 第 2 作者, 专利号: 201510583737.5

出版信息

   
发表论文
(1) Tumor Detection Using Magnetosome Nanoparticles Functionalized with A Newly Screened EGFR/HER2 Targeting Peptide, Biomaterials, 2017, 第 11 作者
(2) Chiral Nanoparticle as a New Efficient Antimicrobial Nanoagent, Adv Healthc Mater., 2017, 第 11 作者
(3) Nanoparticle abraxane possesses impaired proliferation in A549 cells due to the underexpression of glucosamine 6-phosphate N-acetyltransferase, Int J Nanomedicine, 2017, 第 11 作者
(4) Interaction of gold and silver nanoparticles with human plasma: Analysis of protein corona reveals specific binding patterns, Colloids Surf B Biointerfaces, 2017, 第 11 作者
(5) Peptide probes derived from pertuzumab by molecular dynamics modeling for HER2 positive tumor imaging, PLoS Computational Biology, 2017, 第 11 作者
(6) Polymer–KLAK Peptide Conjugates Induce Cancer Cell Death through Synergistic Effects of Mitochondria Damage and Autophagy Blockage, Bioconjugate Chemistry, 2017, 第 11 作者
(7) Temperature-Triggered Chiral Self-Assembly of Achiral Molecules at the Liquid–Solid Interface, ACS Appl. Mater. Interfaces, 2016, 第 5 作者
(8) HER2 Targeting Peptides Screening and Applications in Tumor Imaging and Drug Delivery, Theranostics, 2016, 第 11 作者
(9) High-Throughput Peptide Screening on a Bimodal Imprinting Chip Through MS-SPRi Integration, Methods Mol Biol, 2016, 第 11 作者
(10) An Evaluation of Blood Compatibility of Silver Nanoparticles, Scientific Reports, 2016, 第 11 作者
(11) Quantitative Proteomic Analysis of Cellular Resistance to the Nanoparticle Abraxane, ACS Nano, 2015, 第 11 作者
(12) Structure-based Design of Peptides with High Affinity and Specificity to HER2 Positive Tumors, Theranostics, 2015, 第 11 作者
(13) Abraxane, the Nanoparticle Formulation of Paclitaxel Can Induce Drug Resistance by Up-Regulation of P-gp, Plos One, 2015, 第 11 作者
(14) Bimodal Imprint Chips for Peptide Screening: Integration of High-Throughput Sequencing by MS and Affinity Analyses by Surface Plasmon Resonance Imaging, Anal Chem., 2014, 第 11 作者
(15) Impact of protein stability, cellular localization and abundance on proteomic detection of tumor-derived proteins in plasma, Plos One, 2011, 第 1 作者
(16) Brain specific proteins decline in the cerebrospinal fluid of humans with Huntingtons Disease, Molecular and Cellular Proteomics, 2009, 第 1 作者
(17) A Software Platform for Rapidly Creating Computational Tools for Mass Spectrometry-Based Proteomics, Journal of Proteome Reserach, 2009, 第 4 作者
(18) Protein refolding in silico with atom-based statistical potentials and conformational search using a simple genetic algorithm, Journal of Molecular Biology, 2006, 第 1 作者
(19) Enhanced sampling near the native conformation using statistical potentials for local side-chain and backbone interactions, Proteins: Structure, Function, and Genetics, 2005, 第 1 作者
(20) A consistent set of statistical potentials for quantifying local side-chain and backbone interactions, Proteins: Structure, Function, and Genetics, 2005, 第 1 作者
(21) Prediction of protein structure by emphasizing local-sidechain/backbone interactions in ensembles of turn fragments, Proteins: Structure, Function, and Genetics, 2003, 第 1 作者
(22) A histone fold TAF octamer within the yeast TFIID transcriptional coactivator, Nature Structure Biology, 2001, 第 3 作者
发表著作
   

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 纳米材料生物效益与安全性的组学研究, 主持, 部委级, 2013-02--2016-12
( 2 ) 趋磁细菌纳米磁小体膜蛋白组学研究, 主持, 省级, 2014-01--2016-12
( 3 ) 纳米生物效应与安全性系统研究, 参与, 部委级, 2015-01--2017-12
( 4 ) 单细胞精确操纵与基因组测序新方法在肿瘤防治中的应用研究, 参与, 国家级, 2015-01--2018-12
( 5 ) 果蝇眼睛蛋白组研究, 主持, 研究所(学校), 2017-01--2017-12
( 6 ) 磁小体作为新型天然MRI对比剂的生物相容性研究, 主持, 省级, 2017-10--2020-10
参与会议
(1)Proteomics based study on the interactions of nanoparticles and biomolecules   2018中国生物物理学会纳米生物学分会学术年会暨“后基因组时代的纳米科技”科学与技术前沿论坛   2018-04-06
(2)磁小体的应用及其膜蛋白组的研究   2017年第七届“趋磁细菌研究及其应用”研讨会   2017-09-22
(3)Proteomics based study on the interactions of nanoparticles and biomolecules   2016福州纳米会议   2016-12-09
(4)Evaluating the accuracy of sub-cellular Proteomic-based prediction of extracellular and intracellular proteins   Qiaojun Fang   2009-05-29
(5)Evaluating Quantitative Proteomics Data of Tumor Cells and Plasma to Identify Markers of Therapy Response. NCI Nanotechnology Alliance Investigators Meeting   Qiaojun Fang?, Kian Kani?, Anjali Jain?, Vitor M. Faca?, Damon H. May?, Parag Mallick?§, Martin W. McIntosh   2008-09-12
(6)rotein Structure Prediction Using Fragment Ensembles with Highly Favorable Ramachandan / Rotamer Propensities   Qiaojun Fang and David Shortle   2002-12-01

合作情况

   
项目协作单位
   

指导学生